切换响应在COVID的增加呼吸风险背后
2022年1月14日
牛津大学MRC Weatherall分子医学研究所的研究人员已经确定了一种负责使Covid-19的呼吸衰竭风险增加一倍的基因。
在詹姆斯·戴维斯(James Davies)教授和吉姆·休斯(Jim Hughes)教授的带领下,该小组研究了染色体3上的一系列DNA如何使年龄在65岁以下的成年人死亡的风险增加一倍,以增加这种风险以及如何做到这一点。
Gene Congulation教授的研究共同领导教授Jim Hughes教授说:“事实证明这是如此难以解决的原因是,先前鉴定的遗传信号会影响基因组的“暗物质”。我们发现,增加的风险不是因为编码蛋白质的基因差异,而是因为DNA的差异使开关打开基因。检测受这种间接开关效果影响的基因要困难得多。
使用经过训练的人工智能算法来分析整个体内细胞的大量细胞遗传数据,以表明遗传信号可能会影响肺部的细胞,然后研究人员在遗传信号下对DNA放大。这检查了数十亿个DNA字母如何折叠以适合细胞内部,以查明由序列控制的特定基因,从而导致更大的风险发生严重的covid-19。
领导休斯研究小组实验室工作的达米安·唐斯(Damien Downes)博士说:“令人惊讶的是,由于怀疑其他几个基因,数据表明,一个称为lztfl1的基因会引起这种影响。”
While this higher risk version of the gene probably interferes with cells lining the airways and lungs, the researchers pointed out that it doesn’t affect the immune system, so expected that people carrying this version of the gene would respond normally to vaccines. They were also hopeful that the findings would lead to the possibility of other customised drug and therapy treatments for those more at risk.
Study co-lead Prof James Davies, who worked as an NHS Consultant in Intensive Care Medicine during the pandemic and is an Associate Professor of Genomics at Oxford University’s Radcliffe Department of Medicine, said: ‘The genetic factor we have found explains why some people get very seriously ill after coronavirus infection. It shows that the way in which the lung responds to the infection is critical. This is important because most treatments have focussed on changing the way in which the immune system reacts to the virus.’
有60%的南亚血统的人具有这种高风险的基因,而欧洲血统的人中有15%,部分解释了前者组的死亡率和住院率较高。该研究还发现,有2%的非洲加勒比血统患者具有较高的风险基因型,这意味着该遗传因素并不能完全解释黑人和少数族裔社区报告的较高的死亡率。
戴维斯教授解释说:‘在某些黑人和少数族裔社区中,发现更高的DNA守则是更常见的,而在另一些族裔社区中则没有发现。社会经济因素也可能在解释为什么某些社区受到COVID-19-19的大流行的影响特别严重。
‘尽管我们无法改变遗传学,但我们的结果表明,具有较高风险基因的人可能会特别受益于疫苗接种。由于遗传信号会影响肺而不是免疫系统,因此意味着应由疫苗取消风险。’
发表在自然遗传学中
更多信息在线的