基因组研究为SARS-CoV-2进化提供了线索

伦敦大学学院的遗传学学院领导的这个项目,分析了超过7500人感染的病毒基因组Covid-19,已经确定了接近200年病毒的复发性基因突变,高亮显示它如何适应和发展人类宿主。

研究人员发现,大部分的全球遗传多样性SARS-CoV-2发现在所有受灾最严重的国家,表明广泛的全球传播的早期流行和没有单一的病人0在大多数国家。结果也进一步证实病毒最近才出现在2019年末,之前在全球范围内迅速蔓延。

独立科学betway88体育官网家们发现198基因突变似乎已经发生不止一次,可能病毒是如何适应的线索。

该研究教授弗朗索瓦Balloux(伦敦大学学院的遗传学研究所)说:“所有病毒自然变异。突变本身并不是一件坏事,没有什么建议SARS-CoV-2变异快或慢于预期。到目前为止,我们不能说SARS-CoV-2是否或多或少成为致命的传染性。”

小的基因变化,或突变,确定没有均匀地分布在病毒基因组。基因组的某些部分已经很少突变,研究人员说这些不变的部分病毒可能是更好的药物和疫苗开发的目标。

“战胜病毒的一个重大挑战是疫苗或药物可能不再有效,如果病毒突变。如果我们集中我们的努力的部分不太可能变异的病毒,我们有更好的机会发展药物将长期有效,”Balloux教授解释道。“我们需要开发药物和疫苗,病毒无法轻易逃避。”

位联席作者露西范博士村落(伦敦大学学院的遗传学研究所)补充道:“还有很少之间遗传差异或突变病毒。我们发现这些差异发生多次,独立于彼此在流感大流行期间,我们需要继续监控这些越来越多的基因组可用,开展研究,从而准确地理解他们所做的事情。”

结果添加到越来越多的证据表明SARS-CoV-2病毒共享一个共同的祖先从2019年底,表明这是病毒从先前的动物宿主时进人。这意味着它是最不可能的病毒导致人类循环Covid-19是很久以前就被检测到。在许多国家,包括英国在内的病毒样本的多样性一样,看到整个世界,这意味着病毒进入英国独立无数次,而不是通过任何一个指数的情况。

研究小组已经开发出一种新的互动,开源的在线应用程序,以便研究人员在全球范围内也可以检查病毒基因组和类似的方法适用于更好地理解其发展。

van村落博士说:“能够分析这样一个相当数量的病毒基因组在大流行的头几个月可能是宝贵的药物开发的努力,甚至展示了基因组研究已经走了多远的在过去的十年。我们都受益于一个巨大的努力,数以百计的研究人员在全球范围内被病毒基因组测序和网上。”

这项研究是由伦敦大学学院的研究人员生命科学和医学科学,与同事Cirad和大学同学聚会,牛津大学和伦敦帝国理工学院,牛顿基金中英国家自然科学基金委支持的主动性和生物技术和生物科学研究委员会(BBSRC)。访问www.ucl.ac.uk

5月6日发表在感染、遗传与进化